My favorites | Sign in
Project Home Downloads Wiki Issues Source
READ-ONLY: This project has been archived. For more information see this post.
Search
for
graafimuokkausjuttuja  
One-sentence summary of this page.
Updated Jun 17, 2011 by tulila...@gmail.com

tässä tarvittavat haku- ja suodatuskentät:

Reads

  • readin min. ja max. pituus (ei välttämätön)

Read vs database sequence alignments (linjaus)

  • min. bit score: näytetään rajan ylittävät kaaret ja niihin liittyvät readit
  • max. e value: näytetään rajan alittavat kaaret ja niihin liittyvät readit
  • näytetään max. k parasta linjausta jokaiselle tietokantasekvenssille kerrallaan

Database sequences

  • laji: näytetään vain valittujen lajien sekvenssit (vain UniProt)
  • kanta: näytetään vain tietyn tietokannan sekvenssit kerrallaan (ja niihin liittyvät readit ja entsyymit)

Enzymes (EC-numero)

  • EC-numero-haku
  • haku entsyymin nimen perusteella

Reactions

  • haku reaktion R-koodin (KEGG) perusteella

Metabolites/compounds

  • haku metaboliitin C-koodin (KEGG) ja nimen perusteella
Powered by Google Project Hosting