Demottavat asiat:
- haut (ainakin entsyymillä)
- graafin kaikki tiedot
- tooltipit
- lisätiedot klikkaamalla oikeaan sivupalkkiin
- oikeaklikkivalikko
- linkit ulkoisiin kantoihin
- alignment
- graafissa kulku
- noodien avaus
- tägäys ym.
- lisää noodeja
- poisto (jos ehditään toteuttamaan)
- contract (jos säilytetään & fiksataan, luultavasti ei)
- värien säätö
- bitscorefiltteröijä (jos saadaan toimimaan)
Esimerkkikäyttötapauksehdotuksia:
- Etsi DB-entry O05625, näytä sille jokin linjaus, tagaa lähin entsyymi, katso sen tiedot ja tagaa polku siitä eteenpäin ja poista tagaamattomat
- Etsi 4.1.1.1 -> Q9P7P6 -> 201803651; avaa 1.4.1.13:sta pathway Nitrogen metabolism
- Hae alcohol dehydrogenase ja säädä kaaret niin että kaikista kaarista tulee vihreitä. Sitten hae lisää yhteyksiä oikeaklikkauksen kautta keskinodelle. Sitten pikafiltteröi kaikki alle 353:n arvoiset pois
Parannusehdotuksia:
- Sample selection -> vain tietyt näytteet
- metadataa lisää (esim. syvyys tai sijainti)
- skaalautuvuus?
- datan/graafin dumppaaminen/export HALUTUIN ON KAIT TÄMÄ: kuvana ja/tai sekvenssit ulos?
- tilanteen tallentaminen
- avaako lisäyhteydet alle bitscoren?
- bugi: hakee aina samalla e-valuella
- bugi:subgraphin tagaaminen ei toimi
- kahden eri entsyymin välistä yhteyttä ei voi hakea? pitäisikö voida?
- useampi alignment kerralla, linjauksiin id:t (voin tehdä, T: Aurora)
- Undo
- useampi kuva yhtäaikaa?
- pitäiskö myös huonoimpia hittejä päästä katselemaan? Esalta pitää kysyä. Nyt on ongelmana se että jos hittejä on liikaa niin viimeisiä ei millään saa näkymään.