#Taller de visualizacin en Gephi

Introducción

Gephi es una plataforma Open Source para el análisis y visualización de redes. Actualmente es un Consorcio para garantizar el desarrollo de la plataforma.

Funciona sobre Java y por tanto es multiplataforma

Vídeo de la versión =0.7

Características

• Interfaz intuitiva
• Admite Múltiples formatos de entrada, el suyo propio GEXF, los hererdados NET y DOT , CSV y otros más
• Customizable por plugins
• Muy buena documentación
• En evolución constante, actualmente en la versión 0.7
• Tiene detrás una comunidad

Funcionalidades

• Interactividad: Permite interactuar con el grafo, creando grupos de nodos, comprimiéndolos y expandiéndolos, ver la conectividad de cada nodo de forma visual.
• layout :Tiene algoritmos de layout de force based y Multi level
• Color: El color del los nodos se puede aplicar por paticiones o por ranking
• Tamaño nodos/enlaces: El tamaño de los nodos y los enlaces se puede representar según su importancia
• Tiene un conjunto de atributos configurables como el font, el color de y tamaño del font, etc..
• Es posible generar grafos dinámicos en función del tiempos del enlace (requiere formato GDF).

Data Set

Desde los Tweets obtenidos del pasado mundial de Baloncesto se han creado un conjunto de relaciones basadas en la mención, es decir los nombres de usuarios Twitter que aparecen en el texto del tweet. Dado que el tamaño de la red podría ser demasiado grande para la práctica se han seleccionado los nodos que han tenido más de 5 menciones. En este data set hay tres grupos de usuarios: Los más mencionados, los más activos y los usuarios normales.

Visualización

Datos de entrada

Para evitar complicaciones en la conversión a otro formato propuse que en el taller la entrada fuera en formato CSV, un formato ampliamente usado en otras herramientas, los nodos y los enlaces. Al hacer la práctica de las particiones, no funcionó bien porque el programa no entendía los atributos del nodo, por ejemplo el grupo al que pertenecía el nodo( Top_mentions: grupo de los 50 usuarios más mencionados, Top_twitters grupo de los más activos y normales, el resto de usuarios). Consulté el foro de Gephi vi que los CSV no sirven cuando se quiere importar las propieddaes del nodo Para dejar la práctica funcionando al 100% los datos de entrada estarán en formato GDF, que es un formato muy sencillo, casi como el CSV. Por tanto el fichero de entrada será: Turkey2010_most_mentions.gdf

Layouts

• Base forced Con fuerzas de atracción y repulsión que se pueden ajustar
• Multilevel

Formatos Salida

• SVG
• PDF

Práctica

Bajar los ficheros entrada y abrir programa

• Bajar los ficheros en formato GDF: turkey2010_mentions_most_nodes.gdf
• Abrir el programa gephi
• Abrir un nuevo proyecto File > Open En la esquina inferior derecha pondrá workspace 0 (puede haber más de un workspace). Aparecerá una ventana como esta:

• Si no aparece abierta la ventana Graph, abrirla con Window > Graph.

*nota*: El zoom del grafo se hace con la rueda del ratón y se mueve pulsando el botón derecho a la vez que se mueve el ratón. 
        La ventana Graph es interactiva y cualquier cambio que se aplique al grafo queda reflejado. 
        Se puede actuar sobre los nodos directamente con el ratón.

Debe salir algo así:

• Para dale forma al grafo, abrir la ventana de layout Window > Layout y elegir un layout. En este caso se ha elegido Force Atlas.

Tendrá este aspecto:

• Para darle color y tamaños a los nodos según la importancia, abrir la ventana Window > Ranking
• Tamaño: En la pestaña de Nodes, pulsar el diamante, elegir en el desplegable Degree (Número de enlaces del nodo) y establecer el tamaño entre 5 y 20. Pulsar Apply. Observar cómo cambian de tamaño los nodos (usar zoom si no se aprecia bien en la vista del grafo).

Así se verá el tamaño:

• Color: En la misma pestaña, pulsar en color, elegir la gama de color y pulsar Apply.

Así se verá el color:

• Para ver cual será el aspecto final, abrir las ventanas de previsualización Window > Preview y Window > Preview settings.

*Nota*: La ventana de preview no es interactiva.

Pulsar en Refresh y Tendrá este aspecto:

• Para darle color a los nodos según una agrupación, abrir la ventana Window > Partition. Aparecen los distintos grupos (Si no aparece ninguno pulsar en el icono de refrescar). Elegir Group Pulsar Apply y se verá como ahora los nodos están coloreados según los grupos por estos colores:
• Rojo Los más mencionados
• Azul los más activos (que más han twiteado)
• verde El resto

Esta es la previsualización resultante:

¿Pero que es esa mancha grande de la izquierda?

Es una celebrity (Justin Bieber) que ha tenido muchísimas menciones de un fan.

Este sería el zoom:

• Para filtrar nodos del grafo, abrir la ventana de filtros Window > Filters. En la ventana de Filters aparecen todas las opciones de filtrado de nodos. Vamos a ver dos casos:
• Filtrado por enlaces: Seleccionar Library >Topology > Degree Range y moviendo la barra inferior para ajustar el rango de enlaces del nodo y pulsando Filter se verá como va cambiando el grafo conforme movemos la barra inferior. Este es el grafo resultante de filtrar 7 - 132:

• Filtrado por grupos: Seleccionar Attributes > Partition > Grupos. Si se selecciona Mentions y Twitter y se le hacen algunos ajustes en los setting de previsualización:

• Backgroud negro
• Hacer visibles las etiquetas de los nodos
• Poner las etiquetas en color blanco
• Poner tamaño de letra de las etiquetas en 24

Puede quedar algo asi:

1. Finalmente, mirar las estadísticas Windows > Statistics

Exportar

1. Exportar el gráfico File > Export

Guardar el trabajo realizado

• Salvar el proyecto File > Save